cgatools::command::Cigar Member List

This is the complete list of members for cgatools::command::Cigar, including all inherited members.

add_back(const CigarElement &e)	cgatools::command::Cigar
back() (defined in cgatools::command::Cigar)	cgatools::command::Cigar	[inline]
Cigar() (defined in cgatools::command::Cigar)	cgatools::command::Cigar	[inline]
Cigar(const std::string &cigar, bool mergeNeighbours=false, bool removeZeros=false) (defined in cgatools::command::Cigar)	cgatools::command::Cigar	[inline]
getParsedCigar() const (defined in cgatools::command::Cigar)	cgatools::command::Cigar	[inline]
getReferenceLength() const	cgatools::command::Cigar
getSequenceLength() const	cgatools::command::Cigar
operator<< (defined in cgatools::command::Cigar)	cgatools::command::Cigar	[friend]
operator[](size_t i) (defined in cgatools::command::Cigar)	cgatools::command::Cigar	[inline]
parse(const std::string &cigar, bool mergeNeighbours, bool removeZeros) (defined in cgatools::command::Cigar)	cgatools::command::Cigar
ParsedCigar typedef (defined in cgatools::command::Cigar)	cgatools::command::Cigar
parsedCigar_ (defined in cgatools::command::Cigar)	cgatools::command::Cigar	[protected]
push_back(const CigarElement &e) (defined in cgatools::command::Cigar)	cgatools::command::Cigar	[inline]
size() const (defined in cgatools::command::Cigar)	cgatools::command::Cigar	[inline]
trancatePaddings() (defined in cgatools::command::Cigar)	cgatools::command::Cigar