cgatools::command::SamSequenceSplitter Member List

This is the complete list of members for cgatools::command::SamSequenceSplitter, including all inherited members.
cigar_ (defined in cgatools::command::SamSequenceSplitter)cgatools::command::SamSequenceSplitter
convert() (defined in cgatools::command::SamSequenceSplitter)cgatools::command::SamSequenceSplitter [protected]
SamSequenceSplitter(const Cigar &extCigar, const std::string &dnbSequence, const std::string &dnbScore, bool negativeStrand) (defined in cgatools::command::SamSequenceSplitter)cgatools::command::SamSequenceSplitter
scores_ (defined in cgatools::command::SamSequenceSplitter)cgatools::command::SamSequenceSplitter
sequence_ (defined in cgatools::command::SamSequenceSplitter)cgatools::command::SamSequenceSplitter
srcExtCigar_ (defined in cgatools::command::SamSequenceSplitter)cgatools::command::SamSequenceSplitter
srcScores_ (defined in cgatools::command::SamSequenceSplitter)cgatools::command::SamSequenceSplitter
srcSequence_ (defined in cgatools::command::SamSequenceSplitter)cgatools::command::SamSequenceSplitter
tagCigar_ (defined in cgatools::command::SamSequenceSplitter)cgatools::command::SamSequenceSplitter
tagScores_ (defined in cgatools::command::SamSequenceSplitter)cgatools::command::SamSequenceSplitter
tagSequence_ (defined in cgatools::command::SamSequenceSplitter)cgatools::command::SamSequenceSplitter
 All Classes Namespaces Files Functions Variables Typedefs Enumerations Enumerator Defines
Generated by  doxygen 1.6.2