Here is a list of all documented class members with links to the class documentation for each member:

- r -

• randomGaps() : cgatools::mapping::GapEst::GapsEstimator
• range_ : cgatools::variants::Call
• read() : cgatools::junctions::JunctionFile
• ref_ : cgatools::variants::AlleleDiffSegment
• reference_ : cgatools::variants::Call
• refSequence() : cgatools::variants::Call
• regroupMappings() : cgatools::mapping::MergedMap2SamConverter
• RELAXED_CHECKING : cgatools::util::DelimitedLineParser
• reorderAlleles() : cgatools::variants::Locus
• requireParam() : cgatools::command::Command
• reweightDoubleArmMappings() : cgatools::mapping::MergedMap2SamConverter
• reweightSingleMappings() : cgatools::mapping::MergedMap2SamConverter
• rhs_ : cgatools::variants::AlleleDiffSegment
• rhsCalls_ : cgatools::variants::AlleleDiffSegment
• run() : cgatools::command::Evidence2Cache , cgatools::command::DecodeCrr , cgatools::command::Crr2Fasta , cgatools::command::Command , cgatools::command::CallDiff , cgatools::command::Map2Sam , cgatools::command::ListVariants , cgatools::command::TestVariants , cgatools::command::JunctionType , cgatools::command::SnpDiff , cgatools::command::MergedMap2Sam , cgatools::command::VarFileCombine , cgatools::command::Fasta2Crr , cgatools::command::Join , cgatools::command::JunctionDiff , cgatools::command::ListCrr , cgatools::command::Evidence2Sam , cgatools::command::JunctionCmp